Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tff2Q03404 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms