Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnnb1Q02248 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms