Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snai1Q02085 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms