Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HmgcrQ01237 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms