Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbp1Q00915 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms