Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms