Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms