Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gfra1P97785 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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