Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig3P97386 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lig3P97386 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms