Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg1P97376 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg1P97376 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg1P97376 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg1P97376 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg1P97376 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg1P97376 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms