Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms