Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Arf1P84078 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Arf1P84078 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Arf1P84078 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Arf1P84078 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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