Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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