Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shox2P70390 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Shox2P70390 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shox2P70390 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms