Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms