Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms