Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms