Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcbp1P60335 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcbp1P60335 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms