Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ythdf1P59326 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms