Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scarf2P59222 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms