Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Usp25P57080 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Usp25P57080 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Usp25P57080 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Usp25P57080 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Usp25P57080 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Usp25P57080 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Usp25P57080 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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Usp25P57080 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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Usp25P57080 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Usp25P57080 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp25P57080 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp25P57080 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Usp25P57080 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Usp25P57080 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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