Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms