Protein–RNA interactions for Protein: P55144

Tyro3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyro3P55144 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tyro3P55144 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tyro3P55144 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms