Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms