Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PctpP53808 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PctpP53808 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms