Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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