Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms