Protein–RNA interactions for Protein: P51945

Ccng1, Cyclin-G1, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccng1P51945 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccng1P51945 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms