Protein–RNA interactions for Protein: P50711

Defa13, Alpha-defensin 13, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa13P50711 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa13P50711 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa13P50711 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms