Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa8P50706 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa8P50706 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa8P50706 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa8P50706 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defa8P50706 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa8P50706 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa8P50706 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa8P50706 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa8P50706 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa8P50706 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa8P50706 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa8P50706 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa8P50706 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa8P50706 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa8P50706 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa8P50706 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa8P50706 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa8P50706 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa8P50706 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa8P50706 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa8P50706 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa8P50706 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa8P50706 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa8P50706 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa8P50706 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa8P50706 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Defa8P50706 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Defa8P50706 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa8P50706 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa8P50706 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa8P50706 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa8P50706 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa8P50706 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa8P50706 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa8P50706 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa8P50706 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa8P50706 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Defa8P50706 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa8P50706 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa8P50706 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa8P50706 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa8P50706 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa8P50706 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa8P50706 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa8P50706 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms