Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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