Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms