Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtgfrP43117 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms