Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tac1P41539 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tac1P41539 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tac1P41539 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms