Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtlP38585 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtlP38585 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtlP38585 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtlP38585 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtlP38585 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtlP38585 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtlP38585 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtlP38585 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtlP38585 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtlP38585 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtlP38585 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms