Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab20P35295 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab20P35295 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms