Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab23P35288 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab23P35288 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab23P35288 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms