Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp4P35123 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms