Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RxrgP28705 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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