Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd10P28359 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms