Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apex1P28352 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apex1P28352 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apex1P28352 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms