Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb1P28230 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms