Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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