Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdgfraP26618 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfraP26618 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms