Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms