Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb9P20615 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb9P20615 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms