Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NelfeP19426 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NelfeP19426 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NelfeP19426 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NelfeP19426 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NelfeP19426 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NelfeP19426 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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