Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Hoxb1P17919 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Hoxb1P17919 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Hoxb1P17919 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Hoxb1P17919 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Hoxb1P17919 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Hoxb1P17919 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Hoxb1P17919 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Hoxb1P17919 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxb1P17919 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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