Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PcnaP17918 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms