Protein–RNA interactions for Protein: P14206

Rpsa, 40S ribosomal protein SA, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpsaP14206 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms